Vòng Chung kết HKPĐ toàn quốc lần thứ IX – năm 2016, diễn ra từ ngày 20/7 -10/8 tại 2 tỉnh Nghệ An và Thanh Hóa có 14.682 vận động viên tham gia tranh tài ở 15 môn thi đấu. Kết quả chung cuộc, đoàn TP Hồ Chí Minh xếp thứ Nhất toàn đoàn với 342 HCV, 224 HCB, 174 HCĐ; đoàn Hà Nội xếp thứ Nhì với 192 HCV, 166 HCB, 189 HCĐ; đoàn Thanh Hóa xếp thứ Ba với 93 HCV, 88 HCB, 173 HCĐ. Đoàn chủ nhà Nghệ An xếp thứ 12 toàn đoàn với 36 HCV, 33 HCB, 69 HCĐ.
Phát biểu tại lễ bế mạc, ông Uông Chu Lưu – Phó Chủ tịch Quốc hội khẳng định: Thành công của HKPĐ toàn quốc lần thứ IX - năm 2016 thể hiện sự quan tâm, phối hợp chỉ đạo rất chặt chẽ của Bộ GD&ĐT, tỉnh Nghệ An và Thanh Hóa cũng như các địa phương đăng cai vòng khu vực, của các thành viên Ban chỉ đạo, Ban tổ chức. Với trách nhiệm của địa phương đăng cai tổ chức vòng chung kết, tỉnh Nghệ An và Thanh Hóa đã tập trung mọi điều kiện để Hội khoẻ diễn ra đúng kế hoạch và thành công tốt đẹp.
BTC đã tặng cờ xuất sắc cho 10 đoàn VĐV có thứ hạng toàn toàn cao nhất; trao cờ, quà lưu niệm cho 20 đơn vị có thành tích khá và cờ cho 10 đơn vị miền núi có thành tích xuất sắc nhất.